Zapleti punkcije foliklov

Kot pri vsakem kirurškem posegu so tudi pri punkciji foliklov možni zapleti. Močnejša krvavitev v trebušno votlino se pojavi le v 0,03–0,5 % in je posledica poškodb večjih ali manjših žil v mali medenici. Še redkeje pride po punkciji do pelvičnega vnetja. Poleg tega obstaja tudi možnost, da z nepravilno tehniko poškodujemo organe v mali medenici, kot so mehur, sečevod in črevesje.